A venda de bilhetes na Atlânticoline em 2012 foi inferior ao custo dos combustíveis dos dois navios fretados pela empresa pública açoriana para transporte inter-ilhas (Hellenic Seaways e Express Santorini). Segundo o relatório de contas da Atlânticoline, a empresa conseguiu quase 2,8 milhões de euros em vendas e serviços no ano passado. Por outro lado, a empresa que gere o serviço público no transporte marítimo de passageiros e viaturas nos Açores, teve no ano passado mais de 10 milhões de euros de despesas: 6,1 milhões no aluguer dos navios, 3 milhões em combustíveis e quase 500 mil euros em encargos portuários. Ainda assim, a Atlânticoline teve um pequeno lucro de 96 mil euros em 2012, ano em que recebeu um "subsídio à exploração" do GR superior a 9 milhões de euros.